1、審查施工合同的符合性及完備性首先要熟悉招標(biāo)、投標(biāo)文件，關(guān)注施工合同條款與招標(biāo)文件以及投標(biāo)承諾的符合性，檢查是否存在背離條款；其次檢查對(duì)于在招投標(biāo)過程中形成的補(bǔ)遺，修改、書面答疑、詢標(biāo)紀(jì)要、各種協(xié)議等是否均已作為合同文件的組成部分，是否明確解釋順序。
2、審計(jì)施工合同通用條款內(nèi)容的重點(diǎn)檢查合同當(dāng)事人的法人資質(zhì)、合同內(nèi)容是否符合相關(guān)法律和法規(guī)的要求；檢查合同的內(nèi)容是否與招標(biāo)文件的要求相符合；檢查合同條款是否全面、合理，有無遺漏關(guān)鍵性內(nèi)容，有無不合理的限制性條件，法律手續(xù)是否完備；檢查合同雙方是否具有資金、技術(shù)及管理等方面履行合同的能力；檢查合同是否明確規(guī)定雙方的權(quán)利和義務(wù)；檢查合同是否存在損害國家、集體或第三者利益等導(dǎo)致合同無效的風(fēng)險(xiǎn)；檢查合同是否有過錯(cuò)方承擔(dān)締約過失責(zé)任的規(guī)定；檢查合同是否有按優(yōu)先解釋順序執(zhí)行合同的規(guī)定。
3、審計(jì)施工合同專用條款內(nèi)容的重點(diǎn)檢查合同是否明確規(guī)定工程范圍，工程范圍是否包括工程地址、建筑物數(shù)量、結(jié)構(gòu)、建筑面積、工程批準(zhǔn)文號(hào)等；檢查合同的工程質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)是否符合有關(guān)規(guī)定；檢查質(zhì)量保證期是否符合有關(guān)建設(shè)工程質(zhì)量管理的規(guī)定，是否有履約保函；檢查合同是否明確規(guī)定工期，以及總工期及各單項(xiàng)工程的工期能否保證項(xiàng)目工期目標(biāo)的實(shí)現(xiàn)；檢查合同工程造價(jià)計(jì)算原則、計(jì)費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)及其確定辦法是否合理；檢查所規(guī)定的付款和結(jié)算方式是否合適；對(duì)合同中關(guān)于工程價(jià)款結(jié)算調(diào)整條件應(yīng)在合同專用條款部分針對(duì)招標(biāo)文件作詳細(xì)約定，避免合同在執(zhí)行過程中在施工、竣工結(jié)算階段產(chǎn)生爭(zhēng)議；檢查合同是否明確規(guī)定設(shè)備和材料供應(yīng)的責(zé)任及其質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、檢驗(yàn)方法；檢查隱蔽工程的工程量的確認(rèn)程序及有關(guān)內(nèi)部控制是否健全，有無防范價(jià)格風(fēng)險(xiǎn)的措施；檢查中間驗(yàn)收的內(nèi)部控制是否健全，交工驗(yàn)收是否以有關(guān)規(guī)定、施工圖紙、施工說明和施工技術(shù)文件為依據(jù)；檢查合同所規(guī)定的雙方權(quán)力和義務(wù)是否對(duì)等，有無明確的協(xié)作條款和違約責(zé)任。
4、對(duì)于采用工程量清單計(jì)價(jià)的施工合同重點(diǎn)審計(jì)其條款是否符合《建設(shè)工程工程量清單計(jì)價(jià)規(guī)范》的有關(guān)規(guī)定：合同中只有類似的變更工程的價(jià)格，可以約定參照類似價(jià)格變更合同價(jià)款給與差價(jià)補(bǔ)償原則，防止不平衡報(bào)價(jià)；尤其是對(duì)于清單中沒有涉及到的項(xiàng)目變更，其定價(jià)原則、方式要明確，建議可以采用參照定額組價(jià)的模式，即工程人機(jī)材耗量參考定額，人機(jī)材單價(jià)采用信息單價(jià)，取費(fèi)參照投標(biāo)報(bào)價(jià)；對(duì)于工程量變化綜合價(jià)格的調(diào)整，建議事前約定工程量變化超過規(guī)定幅度值時(shí)綜合單價(jià)的調(diào)整公式；對(duì)材料價(jià)格較大幅度變化等因素造成的價(jià)格調(diào)整，應(yīng)約定分擔(dān)原則或調(diào)價(jià)公式；在施工過程中變更施工方案、采取趕工措施等是否增加費(fèi)用，也應(yīng)加以明確。
